timi天美传孟若羽

团队介绍：

团队长期从事生物医学及细胞生物学研究，围绕癌转移这一关键临床难题，从机理研究、生物标志物鉴定、药物筛选、分子遗传学、纳米技术等多个侧面入手展开转化应用研究，取得了一系列科研成果。发现并阐述了PKCζ、Rictor等一系列信号分子调控细胞运动的功能和机理，初步揭示了一个调控癌细胞趋化运动的信号传导通路。近年来开始将研究领域拓展至纳米肿瘤学领域，进行纳米技术在肿瘤诊疗中的应用研究，建立了一系列肿瘤纳米检测新方法和手段，构建了一系列纳米新材料。在肿瘤遗传学研究方面，揭示了肝细胞肝癌不同病灶间的基因组图谱及其克隆进化关系，为肝癌的诊疗、预后判断以及微转移机理研究提供了依据。近期首次在单细胞精度定义了肝癌的五种免疫微环境亚型（TIMELASER），探究了其细胞组成、空间分布、基因组特征和趋化因子受体-配体网络，深入地证明靶向肿瘤相关中性粒细胞有望形成新的肝癌免疫治疗方案，这些成果为肝癌的基础研究和临床诊疗提供了关键信息。在Nature，Science,Cancer Cell,Nature Biotechnology, Gastroenterology, ACS Nano, Nature Communications, PNAS 等学术期刊发表文章 100 余篇，成果写入国际专家共识 （Nature Review G&H 2020），荣获细胞出版社（Cell Press）2019中国年度论文，分别荣获2021年和2022年全国生物信息学十大进展。

项目情况：

1. 中国自然科学基金委专项基金“基于单细胞组学的胆管癌异质性研究”（82341005）（2023.01.01-2025.12.31），直接经费200万，主持，在研

2. 中国自然科学基金委重点项目“肝癌异质性在药物治疗中的进化及其应用研究”（82030079）（2021.01.01-2025.12.31），直接经费297万，主持，在研

招生信息（拟招生的研究方向）：

肿瘤学

细胞生物学

医学生物信息

科研项目：

1.&苍产蝉辫;中国自然科学基金委专项基金“基于单细胞组学的胆管癌异质性研究”（82341005）（2023.01.01-2025.12.31），直接经费200万，主持

2.&苍产蝉辫;中国自然科学基金委重点项目“肝癌异质性在药物治疗中的进化及其应用研究”（82030079）（2021.01.01-2025.12.31），直接经费297万，主持

3.&苍产蝉辫;中国自然科学基金委面上项目“基于多组学综合分析的混合型肝癌的分子遗传学研究”（81972656）（2020.01.01-2023.12.31），直接经费55万，主持

4.&苍产蝉辫;中国自然科学基金委杰出青年基金项目“癌转移机理的转化应用研究”（81125019）（2012.01.01-2015.12.31），直接经费240万，主持

5. 科技部国家重大科学研究计划项目“基于纳米技术的肝癌早期诊断的研究”（2011CB933100），（2011.01-2015.08），经费2172万，首席科学家

代表性研究成果：

Ruidong Xue#, Qiming Zhang#, Qi Cao#, Ruirui Kong#, Xiao Xiang#, Hengkang Liu, Mei Feng, Fangyanni Wang, Jinghui Cheng, Zhao Li, Qimin Zhan, Mi Deng, Jiye Zhu*, Zemin Zhang*, and Ning Zhang*, Liver tumor immune microenvironment subtypes and neutrophil heterogeneity. Nature. 2022 Dec;612(7938):141-147.

Ruibing Chen, Yun Liu, Hao Zhuang, Baicai Yang, Kaiwen Hei, Mingming Xiao, Chunyu Hou, Huajun Gao, Xinran Zhang, Chenxi Jia, Lingjun Li, Yongmei Li, Ning Zhang*. Corrigendum to article “Quantitative proteomics reveals that long non-coding RNA MALAT1 interacts with DBC1 to regulate p53 acetylation’’. Nucleic Acids Research. 2021 Apr 19;49(7):4199-4202.

Lin Guo#, Xianfu Yi#, Lu Chen#, Ti Zhang#, Hua Guo, Ziye Chen, Jinghui Cheng, Qi Cao, Hengkang Liu, Chunyu Hou, Lisha Qi, Zhiyan Zhu, Yucun Liu, Ruirui Kong, Chong Zhang, Xiaohua Zhou, Zemin Zhang, Tianqiang Song, Ruidong Xue*, Ning Zhang*. Single cell DNA sequencing reveals punctuated and gradual clonal evolution in hepatocellular carcinoma. Gastroenterology. 2021 Sep 2; 162(1):238-252

Jie Zhu#, Jingxiang Wang#, Xin Wang#, Mingjing Gao#, Bingbing Guo#, Miaomiao Gao, Jiarui Liu, Yanqiu Yu, Liang Wang, Weikaixin Kong, Yongpan An, Zurui Liu, Xinpei Sun, Zhuo Huang, Hong Zhou*, Ning Zhang*, Ruimao Zheng* & Zhengwei Xie*. Prediction of drug efficacy from transcriptional profiles with deep learning. Nature Biotechnology. 2021 Jun 17 ;39(11):14444-1452

Ruidong Xue#, Lu Chen#, Chong Zhang#, Masashi Fujita#, Ruoyan Li, Shu-Mei Yan, Choon Kiat Ong, Xiwen Liao, Qiang Gao, Shota Sasagawa, Yanmeng Li, Jincheng Wang, Hua Guo, Qi-Tao Huang, Qian Zhong, Jing Tan, Lisha Qi, Wenchen Gong, Zhixian Hong, Meng Li, Jingmin Zhao, Tao Peng, Yinying Lu, Kiat Hon Tony Lim, Arnoud Boot, Atushi Ohno, Kazuaki Chayama, Zemin Zhang, Steve George Rozen, Bin Tean Teh, Xin Wei Wang, Hidewaki Nakagawa*, Mu-Sheng Zeng*, Fan Bai*, Ning Zhang*. Genomic and transcriptomic profiling of combined hepatocellular and intrahepatic cholangiocarcinoma reveals distinct molecular subtypes. Cancer Cell. 2019 Jun 10;35(6):932-947.e8.