timi天美传孟若羽

团队介绍：

薛瑞栋，研究员，博导，国家优青，北京市科技新星，北大博雅青年学者，任职于timi天美传孟若羽肿瘤转化研究中心、北京大学-云南白药国际医学研究中心、国际癌症研究院及药学院化学生物学系。长期致力于肿瘤基因组学及微环境研究，以（共同）第一/通讯作者发表论文13篇，包括Nature (2022, 2024)、Cancer Cell (2024, 2019)、Gastroenterology (2022, 2016)、Adv. Sci. (2021)等；研究论文被多次同期评述及Nat Rev G&H专门评述，获Faculty Opinions推荐，研究成果纳入国际专家共识，入选2022年度“中国生物信息学十大进展”和“细胞出版社2019中国年度论文”。授权发明专利1项。获中国抗癌协会科技奖一等奖、北大医学青年科技奖、国际肿瘤转移协会青年研究员奖、中国肿瘤标志物学会青年科学家论文特等奖、中国棒棰岛肿瘤前沿论坛青年创新一等奖。担任国际胆管癌研究协会会员，亚太肝病诊疗技术联盟肝胆肿瘤专委会委员、中国抗癌协会肿瘤微环境专委会委员、中国抗癌协会肿瘤标志物专委会青年委员和中国抗癌协会肿瘤基因诊断专委会青年委员等。

项目情况：

聚焦肿瘤基因组学与微环境研究，通过深度结合单细胞/空间/多组学等新技术、生物信息新方法和功能实验，探究肿瘤演化和微环境相互调控的新规律和新机制，发现肿瘤分子诊疗的新靶点和新策略。具体方向如下：

1）肿瘤相关中性粒细胞（罢础狈）的功能异质性和调控机制

2）肿瘤基因组变异、克隆演化与免疫微环境调控的动态关系

3）发展蝉肠笔濒辞颈诲测-蝉别辩测序技术并探索多倍体细胞在组织发育和肿瘤诊疗中的作用

招生信息（拟招生的研究方向）：

肿瘤基因组学

医学生物信息

单细胞时空组学

科研项目：

1. 主持  国家自然科学基金委优秀青年基金项目 “肝癌异质性研究”（82322047）（2024.01 - 2026.12），200万

2. 主持  国家自然科学基金委面上项目 “基于空间转录组学的原发性肝癌异质性研究”（82173035）（2022.01 - 2025.12），54万

3. 主持  北京市科技新星计划 创新新星（20230434854）（2023.10 - 2026.10），40万

4. 课题骨干 国家重点研发计划“前沿生物技术”重点专项 “中国高发肿瘤单细胞多组学整合分析及转化研究”（2023.01-2027.12），120万

5. 主持  国家自然科学基金委青年项目 “基于靶向测序和单细胞技术的肝癌分子遗传研究”（81802813）（2019.01-2021.12），21万 （已结题）

代表性研究成果：

1. Liu Hengkang#, Gao Jiawen#, Feng Mei#, …, Xue Ruidong*, Zhang Ning*, Li Hang*. Integrative molecular and spatial analysis reveals evolutionary dynamics and tumor-immune interplay of in situ and invasive acral melanoma. Cancer Cell 2024; 42(6):1067-1085.e11. 封面论文

2. Chen Lei#, Zhang Chong#, Xue Ruidong#, …, Steven G Rozen*, Bai Fan*, Wang Hongyang*. Deep whole-genome analysis of 494 hepatocellular carcinomas. Nature 2024; 627(8004): 586–593. Highlighted by Nat Rev G&H

3. Xue Ruidong#, Zhang Qiming#, Cao Qi#, Kong Ruirui#, Xiang Xiao#, …, Zhu Jiye*, Zhang Zemin*, Zhang Ning*. Liver tumor immune microenvironment subtypes and neutrophil heterogeneity. Nature 2022; 612(7938): 141-147. “2022 年度中国生物信息学十大进展”

4. Guo Lin#, Yi Xianfu#, Chen Lu#, …, Xue Ruidong*, Zhang Ning*. Single cell DNA sequencing reveals punctuated and gradual clonal evolution in hepatocellular carcinoma. Gastroenterology 2022;162:238-252. Editorial by Gastroenterology

5. Xiang Xiao#, Liu Ziyang#, Zhang Chong#, Li Zhao#…, Xue Ruidong*, Bai Fan*, Zhu Jiye*. IDH mutation subgroup status associates with intratumor heterogeneity and the tumor microenvironment in intrahepatic cholangiocarcinoma. Advanced Science 2021;8:e2101230.

6. Xue Ruidong#, Chen Lu#, Zhang Chong#, Fujita Masashi#, …, Nakagawa Hidewaki*, Zeng Mu-Sheng*, Bai Fan*, Zhang Ning*.  Genomic and transcriptomic profiling of combined hepatocellular and intrahepatic Cholangiocarcinoma Reveals Distinct Molecular Subtypes. Cancer Cell 2019; 35: 932-947 e8. Preview by Cancer Cell, News and Views by Nat Rev G&H,“CellPress 2019中国年度论文” 

7. Xue Ruidong#, Li Ruoyan#, Guo Hua#, …, Zhang Zemin, Xie Sunney Xiaoliang, Bai Fan*, Zhang Ning*. Variable intra-tumor genomic heterogeneity of multiple lesions in patients with hepatocellular carcinoma. Gastroenterology 2016; 150: 998-1008. (#Co-first author) Editorial by Gastroenterology

本课题组常年招收博士后、博士生（北大医院肿瘤学及药学院化学生物学专业）和本科生（药学院），有意者请发提前邮件联系。